از آنجائيكه دوره متوسطه يك دوره انتقالي و تکاملی در پيكره آموزش مي‌باشد يعني انتقال آموزشها از حالت عمومي به آموزشهاي تخصصي، انتقال دانش‌آموزان از دوره نوجواني به جواني و مسئوليت پذيري، انتقال از محيط آموزشي به بازار كار و جامعه و نيز فراهم شدن آمادگي لازم در دانش‌آموزان بويژه در شاخه نظري جهت ورود به تحصيلات عالي و دانشگاهي حساسيت و تلاش جدي متوليان امر تعليم و تربيت را مي‌طلبد، لذا با عنايت به مقدمات فوق مؤسسه فرهنگي آموزشي امام حسين (عليه‌السلام) ضمن توجه ويژه به بعد تربيتي و پرورشي دانش آموزان در اين دوره در راستاي اعتلا و ارتقای سطح علمي آنها طي سه سال برنامه‌هاي متنوعي را طراحي و دنبال مي‌نمايد كه اهم آنها جهت آگاهي شما اعلام می گردد:

1-بكارگيري بهترين ومجرب‌ترين دبيران در دروس‌تخصصي و عمومي در مشهد و شهرستانها.

2-تشكيل کارگروههاي آموزشي به منظور هماهنگي و استفاده از تجارب ارزنده همكاران فرهنگي و انتقال روشها و تکنیک جدید مؤثر در فرایند یاددهی و یادگیری.

3-برگزاري امتحانات هماهنگ هر نيمسال بين كليه دبيرستانهاي مؤسسه در سطح استان خراسان رضوي.

4-اجراي آزمونهاي ادواري و طبقه بندي شده تقويت بنيه علمي در هر پايه تحصيلي و ارائه نتايج آزمونها درگزارشات عملكردي و مقايسه‌اي ويژه دانش آموزان – معلمان – مديريت مدرسه، براساس سيستم نرم‌افزاري تعريف شده و منطبق بر ضوابط سازمان سنجش و آموزش كشور، جهت تمرين و آمادگي و آشنايي هر چه بيشتر با كنكور و نيز شناخت نقاط قوت و ضعف دانش‌آموزان و ارائه رهنمودها و مشاوره لازم به آنان.

5-ارائه خدمات مشاوره‌اي و پشتيباني آموزشي توسط متخصصان در راستاي كسب راههاي موفقيت، برنامه‌‌ريزي، تست زني، مطالعات صحیح دروس و بكارگيري تيمهاي زبده پشتيباني آموزشي و مسئول پايه.

6-فراهم بودن کلاسهای هوشمند و برخورداری از سیستم های آموزشی نوین در مدارس.

7-راه‌اندازي و برگزاري كلاسهاي تقويتي .

8-برپايي جلسات ارائه خدمات مشاوره تحصیلی، شغلي، مذهبي به  دانش‌آموزان و اوليای آنان و ارائه الگوهاي برنامه‌ريزي درسي و راههاي كسب موفقيت.

9-اجراي آزمونهاي مستمر ماهانه و انعکاس نتایج حاصل از آن به اولیا.

10- اجرای آزمونهای مرآت، سنجش، گزینه دو بصورت هماهنگ در کل استان

11- بازديدهاي علمي، فرهنگي در داخل استان (زيارت حرم مطهر، رصدخانه، مراكز تحقيقات گياه شناسي و ...).

12-تشكيل جلسات مستمر شوراي دبيران و بحث و تبادل نظر پيرامون وضعيت درسي و اخلاقي دانش‌آموزان و ارائه راهکار.

13-برگزاري مسابقات فرهنگي هنري (كتابخواني، سرود، تئاتر، تربيت بدني و ...).

14-برگزاري محافل ديني و قرآني و بهره‌گيري از شخصيتهاي علمي و مذهبي .

15-اجراي همايش‌هاي مختلف دانش‌آموزي با موضوعات ‌آموزشي و پرورشي .

16-برگزاری مستمر نماز جماعت به امامت روحانی در تمام ایام.

17-برگزاری نشست های بصیرتی متناسب با موضوعات روز.

18-اعزام دانش آموزان به راهیان نور در قالب طرح تبصره دو.

19-سازماندهی دانش¬آموزان در قالب گروههای علمی، فرهنگی، رزمی، بسیج و ... .

20-مشارکت و برگزاری اردوهای جهادی و طرح هجرت.

21-بهره گیری دانش آموزان از آزمایشگاهها و کارگاههای رایانه ای و مجهز.

22- برگزاری مسابقات آزمایشگاهی در پایه های دهم و یازدهم